泉州市舶司设置于1087年，是宋元国家政权设置在泉州管理海洋贸易事务的行政机构，其设置标志着泉州正式成为开放的国家对外贸易口岸,对宋元泉州的经济繁荣、文化交流以及海洋贸易各参与方的共同发展具有至关重要的意义，反映出泉州港口依托于庞大帝国的独特属性。

市舶司遗址地处泉州城南部的晋江江畔，位于泉州古城罗城的镇南门外、翼城的南薰门内。

根据已开展的考古工作，该遗址中部两处考古探沟内发现了宋元时期的地面遗迹，属于同一座属官方所有的较大型建筑的地面。遗址出土物既有出自本地的德化窑、磁灶窑、东门窑、南安窑的产品，又有来自外地的龙泉窑、越窑、景德镇窑、吉州窑等地的产品。其中元代卵白釉饰有龙纹、花卉纹的瓷器残件为高等级瓷器，佐证了该组建筑群的高规制。遗址西北部的水沟两侧分布有宽约10-20米的地下淤泥层，显示出历史水系的规模。2020年1月被省政府公布为第九批省级文物保护单位。